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北京丰台医院是由始建于1958年原北京铁路分局中心医院与始建于1960年原丰台区医院整合而成的目前全市最大的区域医疗服务中心。 

2021年8月3日，北京丰台医院被北京市卫生健康委员会核定为三级综合医院。

总建筑面积9万余平方米，分为南北两个院区，当前在职职工1069人，设置床位1100张，开放床位607张，32个临床专业学科，10个临床诊疗中心，是首都医科大学教学医院。北京丰台医院经过十几年的持续发展，目前已将成为集医疗、教学、科研、保健于一体的丰台区规模最大、职工人数和床位数量最多的大型综合性医院。

为了进一步实施资源整合，改善就诊环境，区委区政府确定丰台医院提质改建项目为重点工程。北京丰台医院改建项目将医院南北院区两址合一，在北院区及区卫生健康委、区疾控中心等总用地约3.71公顷范围内实施提质改建项目。规划改建后的北京丰台医院将以三级综合医院标准建设，改建后总建筑面积约为11.34万平方米，床位900张，地下停车位750个，以缓解医院停车难的问题，为区域内百姓提供便捷、温馨、舒适的医疗环境。作为区域医疗中心，医院将重点打造心内科、妇产科、骨外科、普外科、神经内科、呼吸内科、消化内科、重症医学科等重点专科诊疗中心，提升丰台地区急危重症、疑难病诊治能力。

为配合该项目顺利实施，北京丰台医院北院区（西安街1号）已经全部搬至南院区（丰台南路99号）。

在建新院区，2022年交付完工。