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深圳市第三人民医院/南方科技大学第二附属医院创建于1985年，是一所集医疗、科研、教学为一体的感染性疾病专科特色鲜明的三级甲等研究型医院，是广东省高水平医院，是国家感染性疾病临床医学研究中心建设单位，目前已建设成为深、港、澳及珠、莞、惠等珠三角地区规模最大、设备最先进、功能最完善的感染性疾病诊疗与研究中心，医院具备深圳市唯一的国家肝、肾器官移植资质，在结核病学科、传染病学科广东省排名双第1位，主要承担深圳和周边地区传染病与重大疫情的防控任务并开展综合医疗服务。

医院以“强专科，大综合”为办院方向，以国家感染性疾病临床医学研究中心建设为核心，感染病国家临床重点专科与器官移植学科建设为两翼，新发传染病及疑难感染病、结核病、肝病、艾滋病为支柱，八个综合性特色专科为支撑的“一体两翼、四梁八柱”的发展战略。

医院占地面积19.84万平方米，现有建筑面积21.1万平方米，总床位达2608张，其中可收治呼吸道烈性传染病的负压病房1008张。医院设有临床科室37个，医技科室9个，国家及省市重点专科17个，设有深圳市肝病研究所，建设有BSL-3实验室和全市医院所独有的SPF级动物室，购置的科研设备总价值超过2亿。医院拥有深圳市首个顶级复合手术室，配备第四代达芬奇机器人；拥有中国第一家智能化整合实验室；配置有全流程高度自动化的 “医院火眼”系统。放射科配备最先进的256排CT，3.0T高场强核磁共振，大平板数字减影血管造影机（DSA）及C臂血管机，乳腺机，数字化双板X线摄影系统和数字化胃肠机等一系列现代化影像检查。

医院现有高级职称305人，博士（后）109人，硕士360人，享受国务院特殊津贴专家2人，享受深圳市特殊津贴专家2人，省市学科带头人18人，博士研究生导师10人，硕士研究生导师47人。医院引进了解放军302医院肝胆外科李志伟、超声科主任李志艳，哈尔滨医科大学附属第四医院微创神经外科学主任初明、呼吸内科主任孔英君，天津市第一中心医院骨科主任姜文学等多位学科带头人。同时医院是南方科技大学第二附属医院、广东医科大学非直属附属医院，是中国科学院大学等6所院校的博士及硕士研究生联合培养单位，是清华大学、中南大学、南华大学等研究生和本科生实习基地。

科研方面，医院借力市委市政府“三名工程”柔性引才，引进了中国医学科学院呼吸病学王辰院士团队、中国科学院微生物所高福院士团队、浙江大学附属第一医院肝胆外科郑树森院士团队等13个院士和国家级重点学科团队，为医院的临床诊治和科学研究后续发展注入强大的力量。近5年来，医院先后承担国家重大科技专项27项，国家、省自然科学基金33项，累计获得科研经费超过5亿元；感染病科引进的香港大学“新发传染病研究团队”获深圳市“孔雀计划”资助2500万元；获得深圳市卫生系统首个国家自然科学基金杰出青年基金；先后获得国家“十二五”传染病重大科技专项分课题18项，国家“十二五”传染病重大科技专项牵头1项。国家“十三五”重大专项子课题2项，分课题25项。近5年共发表SCI论文200余篇，累计影响因子1500余分，包括国际顶尖杂志《N Engl J Med.》、《Science》、《Nature》、《Lancet》、《Nat Genent》、《PLoSPathog》等论文近30篇。国家、省、市级奖项16项，获得发明专利十余项。仅2020年截至10月10日，获得国家、省、市立项58项，盖茨基金资助项目1项，其中国家级项目9项；已被SCI录用文章101篇，累计影响因子达826.656分，其中10分以上文章17篇，30分以上6篇。

专科特色医疗方面，医院是国家感染性疾病（结核病）临床医学研究中心、中国医学科学院深圳传染性疾病诊疗研究中心。医院重点学科感染病科，由结核病科、肝病科、艾滋病科、传染病科、感染ICU、人工肝室、深圳市肝病研究所、广东省新发传染病诊治重点实验室等组成，下设有肝病、肺病、艾滋病、新发传染病4个医学中心。2003年非典疫情时期医院收治确诊病例46例，疑似病例390例，创造了全院无一例SARS 病人院内死亡，600多名职工无一例院内感染的“深圳神话”；2006年禽流感来袭，医院通过有关特异性抗体免疫方法治愈深圳首例人禽流感患者；2009年全球猪流感大爆发，全院收治了来自全球五大洲66个国家和地区的1166例甲流隔离观察患者；2013年至今我院共收治重症禽流感患者44例，借助感染病重点实验室平台，对全部患者实现了精准诊断指导临床抢救治疗，病死率仅9.1%，远低于全国39.6%的病死率；2020年新冠疫情来袭，医院作为深圳唯一定点收治医院，目前共收治新冠肺炎患者471例，在院2例，出院466例，死亡3例，医务人员零感染。

未来，医院将以打造广深医疗高地高水平医院为要求，依托国家感染性疾病（结核病）临床医学研究中心平台，建成粤、港、澳及珠三角地区集医疗、科研、教学与预防保健于一体，国内一流、国际先进水平的现代化三级甲等研究型医院。医院还将积极开展疾病防控领域国际科技交流与合作，推动深圳医疗走出国门。